作為中國最大的林區，內蒙古大興安嶺林區曾達10.67萬平方公里。新中國成立后，為服務經濟建設，大興安嶺被過量采伐和開荒，讓大興安嶺林業資源損失較大。過度采伐加上遍地開荒，風大、雪少的惡劣天氣在林區頻頻出現。1998年，長江、松花江流域發生的特大洪水災害給人們敲響警鐘，天然林保護工程開始啟動。2015年4月，大興安嶺結束漫長的采伐歷史。
但生態修復難度比想象中要大得多，當地干部群眾說，大興安嶺腳下的嫩江曾是森林和草原的分界線，但前些年過度開荒，使林緣由嫩江邊不斷向北退縮。最近幾十年，大興安嶺南部林緣后退200公里左右。大興安嶺問題研究專家巴樹桓表示，「無論是林地還是林間草地，均屬森林功能區，開墾為耕地，肯定對生態造成破壞。」
此外，在森林功能區內使用農藥化肥也對水體造成污染。此外，森林周邊數千萬畝的耕地還給防火工作帶來巨大考驗，由於周邊農業人口較多，前幾年大興安嶺幾乎年年出現火情。
